A t�rt�net egy b�rt�nszer� laborat�riumban kezd�dik, ahonnan megsz�kik az egyik ott tartott diclonius, Lucy. Az �p�leten kereszt�l �tj�t v�r �s k�l�mb�z� szervek jelzik. V�g�l rengeteg ember�let �r�n kiszabadul a fogs�gb�l, �m egy szikl�n tark�l�v�st kap, �s belezuhan a tengerbe.

A tengerparton vagyunk, ahol Kouta �s unokatestv�re, Yuka s�t�lnak. Egyszercsak megpillantanak egy l�nyt kil�pni a tengerb�l. A l�ny csak annyit tud mondani, hogy Nyuu, �gy azt�n elnevezik Nyuunak. �m �k m�g nem tudj�k, hogy a �rtatlan �s kicsit but�cska Nyuu tulajdonk�ppen a v�rre �hes Lucy.

Lucy nyom�ba azonban katon�kat k�ldenek, akiknek feladata elkapni a dicloniust.

Id�k�zben f�ny der�l kisebb (b�r �ltal�ban nagyobb) titkokra, melyek tov�bbi gondolkod�sra k�sztetnek. A k�l�nb�z� �rzelmi sz�lak csak m�g sz�nesebb� teszik az am�gy is folyamatosan p�rg� �s mag�val ragad� anim�t.